Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf16P58334 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf16P58334 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf16P58334 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf16P58334 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms