Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn18P56857 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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