Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckbrP56481 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckbrP56481 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CckbrP56481 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms