Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdaP56389 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdaP56389 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CdaP56389 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CdaP56389 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CdaP56389 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CdaP56389 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CdaP56389 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CdaP56389 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CdaP56389 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdaP56389 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdaP56389 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms