Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd3P55096 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd3P55096 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms