Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NcanP55066 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcanP55066 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcanP55066 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcanP55066 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NcanP55066 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcanP55066 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcanP55066 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcanP55066 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcanP55066 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NcanP55066 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcanP55066 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcanP55066 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NcanP55066 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcanP55066 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcanP55066 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcanP55066 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NcanP55066 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcanP55066 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NcanP55066 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcanP55066 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcanP55066 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcanP55066 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcanP55066 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NcanP55066 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NcanP55066 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcanP55066 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcanP55066 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NcanP55066 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NcanP55066 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcanP55066 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NcanP55066 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcanP55066 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcanP55066 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NcanP55066 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms