Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Faf1P54731 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Faf1P54731 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Faf1P54731 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Faf1P54731 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Faf1P54731 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Faf1P54731 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Faf1P54731 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms