Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbtP53395 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbtP53395 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbtP53395 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbtP53395 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DbtP53395 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DbtP53395 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbtP53395 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbtP53395 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DbtP53395 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbtP53395 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbtP53395 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DbtP53395 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DbtP53395 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DbtP53395 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DbtP53395 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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DbtP53395 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DbtP53395 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DbtP53395 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DbtP53395 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DbtP53395 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms