Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fgd1P52734 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms