Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upp1P52624 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Upp1P52624 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upp1P52624 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upp1P52624 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms