Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2e3P52483 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms