Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcnfP51944 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CcnfP51944 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CcnfP51944 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CcnfP51944 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CcnfP51944 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CcnfP51944 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CcnfP51944 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnfP51944 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CcnfP51944 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CcnfP51944 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CcnfP51944 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CcnfP51944 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CcnfP51944 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CcnfP51944 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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