Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apobec1P51908 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms