Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa6P50704 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa6P50704 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa6P50704 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms