Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TspoP50637 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TspoP50637 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TspoP50637 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TspoP50637 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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TspoP50637 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TspoP50637 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TspoP50637 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TspoP50637 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TspoP50637 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TspoP50637 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TspoP50637 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TspoP50637 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TspoP50637 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TspoP50637 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TspoP50637 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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