Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp9P49962 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Srp9P49962 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srp9P49962 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp9P49962 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp9P49962 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp9P49962 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp9P49962 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp9P49962 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp9P49962 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp9P49962 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp9P49962 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp9P49962 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp9P49962 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp9P49962 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp9P49962 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp9P49962 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.6 ms