Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5P49615 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms