Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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PtpreP49446 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpreP49446 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpreP49446 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpreP49446 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtpreP49446 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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PtpreP49446 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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PtpreP49446 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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PtpreP49446 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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PtpreP49446 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PtpreP49446 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PtpreP49446 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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PtpreP49446 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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PtpreP49446 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtpreP49446 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms