Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rfx2P48379 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx2P48379 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms