Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VdrP48281 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VdrP48281 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VdrP48281 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VdrP48281 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VdrP48281 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VdrP48281 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VdrP48281 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VdrP48281 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VdrP48281 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VdrP48281 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VdrP48281 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VdrP48281 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VdrP48281 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VdrP48281 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms