Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx2P48031 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms