Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gli1P47806 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gli1P47806 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms