Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfsf4P43488 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfsf4P43488 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms