Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms