Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept1P42209 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sept1P42209 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sept1P42209 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sept1P42209 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sept1P42209 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Sept1P42209 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sept1P42209 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 319.9 ms