Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VhlP40338 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VhlP40338 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VhlP40338 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VhlP40338 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VhlP40338 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VhlP40338 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VhlP40338 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VhlP40338 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VhlP40338 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VhlP40338 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VhlP40338 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VhlP40338 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VhlP40338 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VhlP40338 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VhlP40338 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VhlP40338 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VhlP40338 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VhlP40338 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VhlP40338 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VhlP40338 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VhlP40338 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VhlP40338 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VhlP40338 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VhlP40338 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms