Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ThpoP40226 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ThpoP40226 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms