Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk2P38575 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk2P38575 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk2P38575 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk2P38575 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk2P38575 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms