Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Folr1P35846 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Folr1P35846 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Folr1P35846 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Folr1P35846 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Folr1P35846 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Folr1P35846 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Folr1P35846 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Folr1P35846 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms