Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprkP35822 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprkP35822 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprkP35822 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PtprkP35822 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PtprkP35822 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprkP35822 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprkP35822 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprkP35822 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprkP35822 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprkP35822 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprkP35822 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms