Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab20P35295 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab20P35295 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab20P35295 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab20P35295 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms