Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab17P35292 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab17P35292 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab17P35292 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms