Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sftpa1P35242 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sftpa1P35242 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms