Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr2cP34968 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htr2cP34968 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htr2cP34968 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htr2cP34968 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htr2cP34968 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htr2cP34968 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htr2cP34968 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms