Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nedd1P33215 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms