Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxc5P32043 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms