Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc10P31257 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc10P31257 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms