Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd28P31041 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms