Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msr1P30204 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms