Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VtnP29788 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VtnP29788 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VtnP29788 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VtnP29788 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VtnP29788 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VtnP29788 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VtnP29788 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VtnP29788 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VtnP29788 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VtnP29788 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VtnP29788 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VtnP29788 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VtnP29788 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VtnP29788 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VtnP29788 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VtnP29788 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VtnP29788 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VtnP29788 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VtnP29788 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VtnP29788 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms