Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp1P29452 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp1P29452 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp1P29452 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Casp1P29452 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp1P29452 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp1P29452 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms