Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Marcksl1P28667 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Marcksl1P28667 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms