Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BgnP28653 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BgnP28653 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BgnP28653 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BgnP28653 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BgnP28653 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BgnP28653 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BgnP28653 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BgnP28653 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BgnP28653 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BgnP28653 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BgnP28653 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BgnP28653 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BgnP28653 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BgnP28653 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BgnP28653 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BgnP28653 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BgnP28653 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms