Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IppP28575 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IppP28575 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IppP28575 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IppP28575 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IppP28575 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IppP28575 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IppP28575 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IppP28575 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IppP28575 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IppP28575 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IppP28575 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IppP28575 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IppP28575 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IppP28575 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IppP28575 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IppP28575 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IppP28575 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IppP28575 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IppP28575 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IppP28575 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IppP28575 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IppP28575 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IppP28575 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
IppP28575 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IppP28575 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IppP28575 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IppP28575 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IppP28575 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IppP28575 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IppP28575 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IppP28575 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IppP28575 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IppP28575 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms