Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col2a1P28481 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms