Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd10P28359 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms