Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb1P28230 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb1P28230 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms