Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfraP26618 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms