Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms