Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnd1P25322 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms